Индонезийский архипелаг поражает своей уникальной природой. Национальная парковая зона расположена между островами Флорес и Сумбава и включает три острова: Падар, Ринча и Комодо. Помимо указанных, к архипелагу относятся десятки других мелких незаселенных островков. Кроме того, в водах Индонезийского архипелага кишит жизнь: знаменитые коралловые рифы формируют экосистему региона. К заповедной зоне острова Падар, Ринча и Комодо были отнесены в 1980 году.

Почти вся холмистая площадь Комодо покрыта саваннами. Буйная растительность представлена пальмами, терновниками и бамбуковыми зарослями. Удивительный контраст с этим создают ослепительно белые песчаные пляжи. Побережье испещрено коралловыми рифами, вода имеет насыщенный бирюзовый оттенок. Берег испещрен заливами. Местами волны омывают каменистые выступы, скалы, имеющие вулканическое происхождение.

Самым удивительным животным, которое проживает на архипелаге - гигантский варан. Благодаря их устрашающему внешнему виду, огромной пасти остров Комодо еще называют островом драконов. Наиболее крупные особи варанов достигают в длину до 2,5-3,0 метра. При средней массе в 80 кг отдельные экземпляры вырастают до 130 кг! Удар хвоста запросто убивает лосей и косуль, которых это чудовище съедает целиком. Вараны только кажутся неповоротливыми. На самом деле они обладают мгновенной реакцией и достигают скорости до 40 км/час. Почти 900 пар варанов нашли свое пристанище на Комодо. Еще 600 пар обитает на Ринча. Зоологи считают, что современные вараны Комодо произошли от гигантских среднеазиатских варанов, возраст которых насчитывает 30 млн. лет. Средняя продолжительность их жизни - 45-50 лет. Самцы почти в полтора раза крупнее самок.

К другим уникальным по своей редкости животным относят тысячи разновидностей рыб, черепах, акул, китов и пр. Более 260 видов коралловых рифов делают занятия дайвингом среди туристов чрезвычайно популярным.

Большую часть года климат архипелага засушливый, однако бывает и краткосрочный сезон дождей в январе. Немалое влияние на климат Комодо оказывают суховеи Австралии. Температура воздуха на протяжении года изменяется с +15 до +48 градусов цельсия.